Пока основные силы Советского союза готовились штурмовать Зееловские высоты на подступах к Берлину, на других фронтах происходила зачистка территорий от оставшихся частей немецкой армии и её союзников.
На южных фронтах советское наступление разделилось на три направления. Самая крупная группировка войск направилась брать Вену, вдвое меньшие силы пошли на чешские земли, а 340-тысячной группе армий предстояло освободить Словакию и часть Моравии.
Среди наступающих 272 тысячи солдат были из Красной армии, им помогали 68 тысяч румын. По плану советские части осуществляли прорыв фронта и окружали Братиславу с двух сторон, а 2 румынские армии находились во втором эшелоне и должны были развить наступление на флангах.
Сводная группа из немецких, словацких и венгерских сил насчитывала не более 200 тысяч человек. Защитники вдвое уступали нападавшим по числу танков, имели втрое меньше стволов артиллерии и всего 150 самолетов против 645 у СССР.
За два дня до операции стрелковый корпус советской армии переправился через реку Грон и захватил несколько плацдармов, разбив немногочисленного противника. Меньше чем за сутки через реку были наведены переправы, и сразу после массированной артподготовки наступление началось. В данном прорыве участвовал и флот. Корабли Дунайской флотилии поддерживали наземные силы огнем палубной артиллерии и высаживали небольшие десантные группы в тыл к обороняющимся.
Наступление успешно развивалось несмотря на весеннюю распутицу и половодье. К 28 марта ударная группировка расширила прорыв до 135 км по фронту и на 40 км в глубину.
1 апреля 7-я гвардейская армия вышла на подступы к Братиславе. Противник тщательно подготовил город к обороне, создав многочисленные железобетонные огневые точки, противотанковые рвы, минные поля. На улицах были возведены баррикады, противопехотные и противотанковые препятствия. Особенно сильно были укреплены восточные окраины Братиславы.
Чтобы избежать разрушения города, было принято решение овладеть городом путём обхода с северо-запада. Впрочем, восточная окраина столицы Словакии сильно пострадала от ударов корабельных пушек. К 4 апреля все бои в городе прекратились, и он полностью перешел под контроль Красной армии.
Советские солдаты вспоминали, что население было радо их приходу. На улицах возникали стихийные митинги благодарных граждан, превращающиеся в маленькие уличные праздники.
Немцы же отошли за реку Мораву, где держали оборону до 22 апреля 1945 года. Действия советских войск не позволили им соединиться в одну мощную группировку и после переправки через реку 26 апреля РККА за день взяли город Брно, завершив наступательную операцию на данном участке.
Несмотря на слаженные действия и стремительность прорыва, армия СССР потеряла почти 80 тысяч человек, большая часть из которых считается тяжело ранеными. Точных цифр потерь румын и обороняющихся армий нет, но известно, что отдельные части из гарнизона Братиславы позже пытались помешать советским войскам взять Прагу.